在桑傑年巴仁波切 (Sangye Nyenpa Rinpoche) 和天噶仁波切 (Tenga Rinpoche) 的指導下，在1999年，首屆有16名僧眾參加了在光明閉關中心舉行的第一次閉關。
僧眾們完成了佛學院的課程，並會由寺廟及閉關上師作個別評估，然後被安排進行密乘的傳統三年閉關。在這段時間里，膳食安排均會有專責的僧侶照顧。
在嚴謹3年3個月及3週的閉關時間下，第一批僧侶喇嘛離開了閉關，並冠以”喇嘛”的銜頭，以代表圓滿整個甚深傳承教法，便成為”金剛上師”。
在閉關期間，閉關上師會給予閉關修持者嚴謹指導，並不允許他們自由對外連繫，全程均需專注在修持細節上。
在這段時間里，由桑傑年巴仁波切指派出任的閉關上師會指導禪修高階訓練，督管學員學習甚深的密續教法，而桑傑年巴仁波切更會親自指導教授閉關中心的僧侶。
在桑傑年巴仁波切（Sangye Nyenpa Rinpoche）和天噶仁波切（Tenga Rinpoche）的指導下，可以把噶舉傳承的法脈流傳下去。
